贡山县地处我国西南，云南版图西北部，怒江大峡谷的最北端，北部与西藏自治区的察隅县接壤，南面连本州的福贡县山水相联，西部跨独龙江上担当力卡山沿山脊与缅甸相邻国境线172.08km，东面沿碧罗雪山山脊接迪庆州的德钦和维西县。东西横宽约60km，南北纵长约160km。地理坐标东经98º08′~98º56′，北纬27º29′~28º23′之间。贡山县处于“三江并流世界自然遗产”的核心地带，是世界上生物多样性极为丰富的地区之一。

贡山县北接青藏高原，西连缅北高山，地处喜玛拉雅山南延部分余脉滇西横断山脉地带，是欧亚板块和印支板块互相撞击及板块俯冲的缝合线结合部，地质结构十分复杂。地质运动形成的规模巨大的南北走向褶皱山系和深大断裂，加之受新构造运动、第四纪冰川和近代河流深切割等多重影响，使横断山脉的担当力卡山与高黎贡山之间夹峙独龙江，高黎贡山与碧罗雪山之间夹峙怒江由西向东排列，两江从北向南逶迤倾斜伸入穿过全境。贡山境内三山雄伟伫立、两江深切奔腾倾泻，山水相间纵列，由此构成了南北走向的“川”字大地形结构，是怒江大峡谷地貌最典型、物种资源最荟萃、自然景观最壮丽的主要地段，是“三江并流”的核心区，是镶嵌在世界自然遗产三江并流风景区内的一颗璀璨明珠。